Uma grande conquista do Setor de Pesquisa da FBC, em 2011, foi a constituição de um Comitê de Ética e Pesquisa (CEP) próprio da Instituição, aprovado pelo Comitê de Ética e Pesquisa (CONEP). Um CEP próprio proporciona uma maior agilidade na análise dos projetos, de suas emendas, relatórios semestrais e finais e eventos adversos. A agilidade na análise proporciona aos sujeitos de pesquisa e pesquisadores uma maior segurança durante o período de andamento do estudo.
Pela sua reconhecida credibilidade no cenário da cardiologia nacional e internacional, o CEP da Instituição já é atualmente aceito como membro da Federal Assurance (FWA) for the Protection of Human Subjects for International (Non-U.S.) Institutions, orgão que faz parte do United States Departament of Health and Human Services – Office for Human Research Protection."